أنشئت الفرقة عام 1966 وكانت تابعة للمعهد العالى للباليه وقام بتدريبها خبراء من الاتحاد السوفيتى.  قدمت الفرقة أول عــــرض لها فى نفس العام وهو باليه "نافورة باخشى سراى" الذى أخرجه فى ذلك الوقت ليونيد لافروفسكى مدير مسرح البولشوى والذى سُمى "لافروفسكى الكبير".

وبعد هذا العرض اعتمدت الفـرقة على العروض الكلاسيكية ذات الفصل الواحد مثل "جيزيل"، "كسارة البندق"، "بحيرة البجع"، "باخيتا" وذلك تأثرا بالباليه الروسى والكلاسيكى. وبـرزت ضرورة البحث عن شخصية متميزة للفرقة تحفظ لهـا تميزها وهويتها بالإضافة إلى تقديم العروض المعاصرة، فبدأ ظهور الخط المعاصر فى أعمال الفرقة من خلال مخرجين ومصممى رقصات مصريين، ظهر هذا بصورة واضحة عندما قُدم باليه "أوزوريس" للمؤلف الموسيقى جمال عبد الرحيم عام 1984 والذى يحكى أسطورة إيزيس وأوزوريس الفرعونية، كما تم تقديم باليه "حسن ونعيمة"، "ليلة مصرية" وباليه "النيل" (على موسيقى عمر خيرت). بدأت فرقة الباليه تقديم عروضها خارج مصر منذ عام 1972 حيث بدأت فى موسكو وليننجراد وبعد ذلك قدمت عروضها فى بلغاريا، يوغوسلافيا، ألمانيا، فرنسا، إيطاليا، تونس، كوريا والصين. 

انضمت فرقة باليه أوبرا القاهرة إلى فرق المركز الثقافى القومى فى يناير 1991 تحت اشراف المدير الفنى د. عبد المنعم كامل الذى أضاف إلى رصيدها الفنى (الريبرتوار) رؤيته الخاصة فى كل من "روميو وجولييت"، "بحيرة البجع"، "كسارة البندق"، "سندريللا"، "القرصان"، "كارمينا بورانا" و"بوليرو". كما قامت الفرقة بتقديم عدة عروض لأشهر مصممى الرقصات العالميين نذكر منها "لوركيانا"، "حلم تانجو"، "هاملت"، "بالرغم من كل شئ"، "زوربا"، "ألف ليلة وليلة"، "رقصات نلتقى بها"، "أوديسيوس"، "سبارتاكوس"، "طقوس الربيع"، "بينوكيو" و"الشطرنج".

شاركت الفرقة فى العرض العالمى لأوبرا "عايدة" من إخراج  د. عبد المنعم كامل الذى قُدم خلال موسم فى 1998 - 1999، كما قدمت فـى عام 2001 عرض "الليلة الكبيرة" والذى حقق نجاحا مبهرا. وقد تولت الأستاذة إرمينيا جمباريلى كامل منصب المدير الفنى للفرقة منذ عام 2004 وحتى الآن. ومن الجدير بالذكر أن الفرقة قامت مؤخرا بجولات فنية فى كل من المكسيك، فرنسا، إنجلترا، ايرلندا، كوريا، النمسا، الولايات المتحدة الأمريكية، الصين، جمهورية التشيك، إيطاليا، تركيا، لبنان، الأردن، كندا وروسيا.